Правилником о унутрашњем уређењу и систематизацији радних места у Вишем суду у Неготину тренутно је систематизовано укупно 17 радних места са 28 запослених.
Радни задаци и послови обављају се у оквиру следећих организационих јединица:
1. Судска управа
2. Судска писарница
3. Рачуноводство суда
4. Дактилобиро
5. Служба за информатичке послове
6. Техничка служба
